"Exodus Project" olarak adlandırılan uzun mesafe warp'ı aracılığıyla, Worns, Ryer ve "Watchers Nest"in diğer mürettebat üyeleri Dünya'dan kaçmayı başarırlar. O sırada "Ghoul" ile yapılan son savaşa katılan Misaki orada bulunmamaktadır ve onun gözleri önünde Dünya değişir ve bir zaman bariyeri tarafından kuşatılır. Ryer ve diğerleri bu uzay-zaman labirentinden kaçış yolu ararlar ancak Dünya çeşitli formlara dönüşür. Değişen zaman eksenleri nedeniyle sayısız "Şimdi" ortaya çıkar. Ve ayrıca, Exodus Project olayı nedeniyle ortadan kaybolmuş olması gereken Misaki, üstelik hala buradadır. Ryer ve diğerlerinin önünde Misaki'nin farklı formları belirir. Eğitim okulundaki Misaki, çocukluk günlerinden Misaki. Bu yansımalar Misaki'nin içinde var olan çatışmalardan mı kaynaklanıyor? O ikinci kez uyanır ve cevabı elde ettiğinde, tarihin artık tamamen farklı bir yöne doğru ilerlediğini anlar. Misaki, Ryer ve diğerleri gerçek bir mutlu sonu bulabilecekler mi?!

1. 01Divergence EveTV · 2003 · 13 bölümAna hikâye
2. 02Misaki Chronicle: Divergence EveTV · 2004 · 13 bölümAna hikâyeBuradasın

Yayın sırasına göre dizildi (kaynak: AniList). Hikâye içi kronolojik sıra verisi olmadığı için gösterilmez.

• Toshinari YamashitaKarakter tasarımı
• Hiroshi NegishiBaş animasyon yönetmeni
• Mai OotsukaAna animasyon
• Toshinari YamashitaAnimasyon yönetmeni (OP & ED)
• Akira TakataAna animasyon (OP)
• NNaruse TakahashiAna animasyon (OP)
• Akira TakahashiAna animasyon (OP)
• Katsuya KikuchiAna animasyon (1, 8. bölüm)
• Daisuke MatagaAna animasyon (3. bölüm)
• Genichirou AbeAra animasyon (2. bölüm)
• Toshihito NakaAra animasyon (1, 4-6, 8, 10-13. bölüm)
• YYasunori YamadaScreenplay (eps 1, 2, 6, 10)

1. 012315: Allied Forces Military Academy2315 連合軍士官学校03 Oca 200424 dk
2. 022316: Field Training2316 野戦訓練10 Oca 200424 dk
3. 031594: The Assassination of Totomi Hideyoshi1594 太閤暗殺17 Oca 200424 dk
4. 041594: Grotesque Shadow1594 異形の影24 Oca 200424 dk
5. 051936: The 2-2-6 Incident1936 二二六事件31 Oca 200424 dk
6. 062305: Allied Military Naval Base2305 連合軍海上基地07 Şub 200424 dk
7. 07The Two Watcher's Nests2つのウオッチャーズ・ネスト14 Şub 200424 dk
8. 08Soldiers Return戦士の帰還21 Şub 200424 dk
9. 09The Ruin's Secret遺跡の秘密28 Şub 200424 dk
10. 10Hidden Past隠された過去06 Mar 200424 dk
11. 11Overlapping Timelines重なる時間13 Mar 200424 dk
12. 12Mission 4Mission420 Mar 200424 dk
13. 13Misaki岬27 Mar 200424 dk