Lise öğrencisi Ayato Kamina'nın sıradan hayatı, Tokyo aniden fütüristik savaş uçakları tarafından işgal edildiğinde altüst olur. Kaosun ortasında, TERRA adlı bir hükümet örgütünden olduğunu iddia eden Haruka Shitow adında bir kadınla karşılaşır. Ayato'nun, Mulianlar (başka bir boyuttan gelen insansılar) tarafından Tokyo'yu izole etmek ve ele geçirmek amacıyla yerleştirilen "Tokyo Jupiter" adlı bir zaman balonunda yaşadığını açıklar. TERRA, o zamandan beri şehrin etrafındaki bariyeri kırmaya çalışmaktadır. Vahyi işleyemeyen Ayato paniğe kapılır ve kaçar. Büyük bir yumurtanın uyuduğu "Xephon Tapınağı" adlı bir yere götüren sınıf arkadaşı Reika Mishima'ya rastlar. Şarkı söylemeye başlar ve Ayato'nun içinde bilinmeyen bir güç uyanarak onu yumurtadan çıkan RahXephon adlı bir varlığa bağlar. Kısa bir süre sonra Haruka onu tekrar bulur ve Mulianlara karşı savaşma davasına katılmasını sağlamaya çalışır. Mulianlar ve TERRA'nın hedef tahtasında kalan Ayato, bu kaotik yeni dünyada değişmiş anıları ve nihayetinde kendi kimliğini yöneterek amacını sorgulamaya başlar.

1. 01RahXephonTV · 2002 · 26 bölümAna hikâyeBuradasın
2. 02RahXephon: Pluralitas ConcentioFilm · 2003 · 1 bölümYan hikâye
3. 03RahXephon Interlude: Her and Herself/Thatness and TherenessOVA · 2003 · 1 bölümYan hikâye

Yayın sırasına göre dizildi (kaynak: AniList). Hikâye içi kronolojik sıra verisi olmadığı için gösterilmez.

Bu animenin dayandığı ya da ondan uyarlanan yazılı eserler.

AlternatifRahXephonManga · 2001 · ★ 5,4AlternatifRahXephonLight Novel · 2002

1. OP1HemisphereMaaya SakamotoSpotifyYT MusicApple
2. ED1Yume no Tamago (English Version)SpotifyYT MusicApple

Şarkı bilgisi: AnimeThemes.moe · bağlantılar resmî müzik platformlarında arama açar.

• Yutaka IzubuchiOrijinal eser
• Yutaka IzubuchiYönetmen
• Souichi MasuiYardımcı yönetmen
• Tomoki KyoudaYardımcı yönetmen
• Shingo TakebaSeries Composition Assistance
• FFumihiko TakayamaSeries Composition Assistance
• Ichirou OokouchiSeries Composition Assistance
• TTooru NozakiScience Fiction Investigation
• Ryuuichi KanekoScience Fiction Investigation
• Akihiro YamadaKarakter tasarımı
• Yutaka IzubuchiMekanik tasarım
• Kimitoshi YamaneMekanik tasarım

1. 01Invasion of the Capital首都侵攻 - OVER LORD -21 Oca 200224 dk
2. 02God and Man Awaken神人（しんじん）目覚める - AWAKENING -28 Oca 200224 dk
3. 03City of Blood二人の街 - Welcome to our town -04 Şub 200224 dk
4. 04His Own Watch自分の時計 - Watch the year hand -18 Şub 200224 dk
5. 05Nirai Kanaiニライカナイ - On Earth As It Is In Heaven -25 Şub 200224 dk
6. 06Obliterated Cities消滅都市 - Lost Songs Forgotten Melodies -04 Mar 200224 dk
7. 07Day of Assembly集まる日 - Phantom In The Cloud -11 Mar 200224 dk
8. 08Bitterly Cold Holy Night凍る聖夜 - The Dreaming Stone -18 Mar 200224 dk
9. 09Small Shrine of Time時 の 祠 - SANCTUARY -25 Mar 200224 dk
10. 10Sonata of Recollection追憶のソナタ - War In The remembrance -16 Nis 200224 dk
11. 11Kyoja Circuit虚邪回路 - NightMare -23 Nis 200224 dk
12. 12The Black Egg黒い卵 - Resonance -30 Nis 200224 dk
13. 13Human Specimen #1人間標本第1号 - Sleeping Beauty -07 May 200224 dk
14. 14The Boy in the Mirror鏡の中の少年 - Time After Time -21 May 200224 dk
15. 15The Children's Night子供たちの夜 - Child Hood's End -28 May 200224 dk
16. 16Island of Others他人の島 - The Moon Princess -04 Haz 200224 dk
17. 17Return to the Labyrinth迷宮への帰還 - Ground Zero -11 Haz 200224 dk
18. 18The Bond of Blue Blood蒼き血の絆 - The Memory Of A Lost City -18 Haz 200224 dk
19. 19Blue Friendブルーフレンド - Ticket to Nowhere -25 Haz 200224 dk
20. 20The Artisan's Battle綾なす人の戦い - Interested Parties -02 Tem 200224 dk
21. 21The Carved Seal of Xephonゼフォンの刻印 - Good Bye My Friend -30 Tem 200224 dk
22. 22Operation Jupiter Obliteration木星消滅作戦 - Down Fall -06 Ağu 200224 dk
23. 23From Here to Eternityここより永遠に - Where The Sweet Bird Song -13 Ağu 200224 dk
24. 24Doorway to the Tuning調律への扉 - Twin Music -20 Ağu 200224 dk

24 / 26 bölüm gösteriliyor